Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP3Q9Y6F1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms