Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGEF2Q9Y6D5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms