Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms