Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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SH3BP1Q9Y3L3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1Q9Y3L3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1Q9Y3L3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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