Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms