Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms