Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms