Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms