Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms