Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms