Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RNF7Q9UBF6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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