Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms