Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms