Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms