Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMLHEQ9NVH6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms