Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms