Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms