Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms