Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms