Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSHZ2Q9NRE2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms