Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms