Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN4Q9NQP4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms