Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC52A3Q9NQ40 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms