Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms