Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms