Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms