Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms