Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C2orf88Q9BSF0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms