Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms