Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms