Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms