Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3R4Q99570 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms