Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms