Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms