Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms