Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRT1Q96EB6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms