Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms