Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms