Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms