Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CNIH3Q8TBE1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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