Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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