Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms