Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBOF1Q8ND07 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms