Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms