Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N402 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N402 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N402 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N402 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms