Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms