Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXP5

C11orf53, Uncharacterized protein C11orf53, humanhuman

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf53Q8IXP5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C11orf53Q8IXP5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C11orf53Q8IXP5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C11orf53Q8IXP5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C11orf53Q8IXP5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C11orf53Q8IXP5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C11orf53Q8IXP5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C11orf53Q8IXP5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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C11orf53Q8IXP5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf53Q8IXP5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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