Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms