Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms