Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms